Nat. Methods | 新算法利用空间转录组数据构建肿瘤的“空间进化图谱”

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癌症的进展由体细胞突变和染色质重塑共同驱动，包括核苷酸变异（SNV）、体细胞拷贝数变异（CNA）和大规模结构变异等。对批量肿瘤或分离单细胞中的体细胞突变进行测序可揭示肿瘤内部的遗传异质性，并能重建肿瘤的进化史；肿瘤之间也表现出异质性，并能够在物理空间内发生进展。分析肿瘤在时间和空间上的体细胞进化是癌症研究中的一个关键挑战，常因缺乏空间数据而受阻。 近年来，空间测序技术的发展为肿瘤时空演化研究提供了一个有前景的方法，但这类技术仍处于积极发展阶段，尚未得到广泛应用。目前，空间转录组学（SRT）技术能够同时测量肿瘤组织中数千个空间位置的基因表达，但无法直接揭示肿瘤中的基因组突变，特别是CNA这一类关键的基因组变化。 近期，美国普林斯顿大学和华盛顿大学的科研团队合作在 Nature Methods 发表了 ………………………………