重分析10X HD已发表数据带来的启示

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点击 蓝字 关注我们 空间组学是继单细胞测序技术之后的另一个生物技术研究热点，它能够弥补单细胞测序技术无法获取细胞空间分布信息的缺陷。它曾多次被Nature Methods评为年度技术方法。 图1 2024年上半年，10X Genomics推出了最新的空间转录组产品——Visium HD芯片。随后，他们在预印本上发表了一篇名为《Characterization of immune cell populations in the tumor microenvironment of colorectal cancer using high definition spatial profiling》的文章。文章中，研究人员对5例结直肠癌患者的FFPE组织进行了分析，利用Visium HD技术深入探索肿瘤微环境（TME），并结合单细胞RNA-seq和Xenium原位基因表达技术，全面描绘了TME中的免疫细胞类型。 表1 样本信息 文章发表后，吉凯的各位生信同事对该文章HD的分析部分产生了极大兴趣，在第一时间完成了数据下载，并从多种角度进行探索。接下来 ………………………………