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PrimerBank 引物设计方法详解

爱吃洋芋的酸菜鱼  · 公众号  ·  · 2024-07-11 20:26

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Primer Bank是一个提供 经过验 证的PCR引物的数据库 ,这些引物主要针对人类和小鼠基因组,适用于基因表达量的检测或定量(qPCR)。Primer Bank提供的引物信息通常包括引物序列、退火温度(Tm)、产物大小范围以及引物的特异性评估等。设计引物时,可以通过以下步骤进行: 1、访问Primer Bank网站:首先,用户需要访问Primer Bank网站,并选择适当的搜索类型,如NCBI Gene ID、关键词或蛋白质名称等。 2、输入搜索信息:根据需要选择物种和基因ID,然后提交搜索请求。Primer Bank会提供一系列预设计的引物,包括引物序列、预期的PCR产物大小、引物在CDS的位置等信息。 3、选择合适的引物:可以根据引物的长度、Tm值、特异性和位置等参数选择最合适的引物。Primer Bank网站通常会显示多对引物供选择。 4、引物验证:选定引物后,可以使用NCBI的Primer-BLast工具进 ………………………………

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