Nature Genetics | 张鹏/王晨飞/孙毅/曾安团队合作揭示非小细胞肺癌免疫联合化疗的耐药因素

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近日，同济大学附属上海市肺科医院 张鹏 团队联合同济大学生科院 王晨飞 团队，同济大学医学院 孙毅 团队与中科院生化细胞所 曾安 团队，于 Nature Genetics   杂志在线发表题为 Multi-omic profiling highlights factors associated with resistance to immuno-chemotherapy in non-small cell lung cancer 的研究论文。 该研究利用空间转录组，单细胞转录组及bulk转录组测序 （spatial transcriptomics, single-cell and bulk RNA-seq） 、以及多色荧光染色系统刻画NSCLC的TME在新辅助免疫治疗中的动态变化，鉴定出新的生物标志物以及潜在的耐药的新机制。 在该研究中，研究者收集了19例NSCLC新辅助免疫治疗前后的原发肿瘤样本进行空间转录组分析 （10X Visium，Nanostring GeoMx DSP） ，scRNA-seq和bulk RNA-seq。对单细胞转录组的数据质控后总共获得232,080个高质量单细胞，聚类后分为上皮细胞、T细胞、B细胞、髓 ………………………………