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导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Novel Implication of the Basement Membrane for Breast Cancer Outcome and Immune Infiltration”，这篇文章发表在 Int J Biol Sci 期刊上，影响因子为9.2。 结果： 建立BMscore的预后BM基因选择策略 通过BM基因集与研究中使用的三个数据集的交集，作者获得了203个BM基因（图1A）。然后，从数十个候选基因中进行差异表达分析（|log2FC|>1且FDR < 0.05），得到了在TCGA-BRCA中明显上调或下调的77个BM基因。结果以热图（图1B）和火山图（图1C）的形式展示。同时，一个肿瘤图显示了具有最多体细胞突变的前20个BM基因（图1D）。然后，作者在TCGA-BRCA中进行了单变量分析，以获取12个更有可能对进一步考虑至关重要的BM基因（图1E）。更重要的是，作者使用LASSO Cox回归分析确定了六个关键的BM基因，包括LOXL1、FBLN1、FBLN5、SDC1、ADAMTS8和PXDNL（图1F、G）。
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