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导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Identification of the susceptible genes and mechanism underlying the comorbid presence of coronary artery disease and rheumatoid arthritis: a network modularization analysis”,这篇文章发表在 BMC Genomics 期刊上,影响因子为4.4。 结果: CAD与CAD 之间的DEG 在GSE 110008中的所有22,215个基因中,278个DEG(图1A)。在上调基因中,XIST、DEFA 1、ACTA 1和FAM 118 A基因的差异表达最显著,而在下调基因中,DDX 3 Y、RPS 4 Y1、TXLNGY和KDM 5D基因的差异表达最显著。 CAD和RA相关基因获自HPO、OMIM和dbSNP数据库。9个DEG与CAD和RA相关基因两者交集,并且在DEG与CAD相关基因、DEG与RA相关基因、CAD相关与RA相关基因之间分别检测到54、33和485个 交集 基因(图1B)。 共表达模块的鉴定及其与临床性状的相关性 利用WGCNA中的一步网络构建功能,基于CAD和RA的DEG构建基因共表达网络。根据基
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