TEA-GCN——构建可解释的【组织/条件特异性】基因共表达功能网络

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生信益站，一点就有益 ！ 祝友友们天天开心，月月发 CNS~ 设我为🌟星标，每天就能第一时间看到推送啦~ 从公共转录组数据集生成的 基因共表达网络 (GCN) 可以阐明基因之间的共调控和共功能关系， 这使得 GCN 成为预测基因功能的重要工具。然而， 当前的 GCN 构建方法对数据质量很敏感 ，并且所识别的基因之间关系的 可解释性仍然很困难 。为了解决这个问题，研究人员提出了一种新方法—— 双层集成聚合 (TEA-) GCN。 TEA-GCN 利用大型转录组数据集的无监督分区和三个相关系数在两步聚合过程中生成集成 GCN。 研究表明， TEA-GCN 在寻找三种模式物种中基因之间正确的功能关系方面的表现优于目前最先进的方法 ，并且 不仅能够捕捉条件/组织特异性基因共表达， 还能通过使用自然语言处理 (NLP) 来解释它们。 此外，研究人员 发现 TEA-GCN 在识别 转录因 ………………………………