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单细胞测序不同亚群的特异性基因的计算新选择 starTracer

单细胞天地  · 公众号  ·  · 2024-10-28 22:29

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众所周知,单细胞转录组有两种差异分析,首先是不同单细胞亚群之间的,比如t细胞和b细胞,其次是同一个单细胞亚群在不同生物学条件下面的差异比如癌症和癌旁组织的t细胞的差异, 这两个差异分析有的方法学区别很大! 不同单细胞亚群之间的差异分析 : 目的 :比较不同细胞类型(如T细胞和B细胞)的基因表达模式,以揭示它们独特的生物学特性和功能。 数据特点 :通常涉及多个细胞亚群的比较,每个亚群可能包含数百到数千个单细胞。 同一单细胞亚群在不同生物学条件下的差异分析 : 目的 :探究同一细胞亚群(如T细胞)在不同生物学条件(如癌症和癌旁组织)下的基因表达变化,以理解环境或疾病状态对细胞功能的影响。 数据特点 :通常涉及同一细胞类型的内部比较,比较的是同一细胞亚群在不同条件下的表达差异。 区别 : 生物 ………………………………

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