文献分享 ｜Nature Methods｜scEpiChem同时检测单细胞小分子药物靶标结合和表观遗传图谱

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     大家好！ 今天为大家介绍一篇2024年7月发表在Nature Methods 上的文章，题目为“Single-cell EpiChem jointly measures drug–chromatin binding and multimodal epigenome”。 研究者将生物素化小分子与抗生物素抗体一起孵育，结合带有barcode的protein A-Tn5转座酶介导标记过程，可以选择性地分析单个细胞内的特定基因组区域； 通过几轮组合拆分，scEpiChem 可以在一次实验中检索数十万个单细胞谱，可扩展到数百万个单细胞。 文章展示了人类结直肠癌(CRC)类器官中三种小分子与组蛋白修饰、染色质可及性或靶蛋白的单细胞共测定； 综合多模态分析揭示了异质CRC类器官内染色质状态背景下的多种药物相互作用； 进一步揭示了CRC类器官中小分子药物治疗后跨细胞类型的药物基因组结合动力学和自适应表观基因组。     文章通讯作者是北京大学未来技术学院、北京大学-清华大 ………………………………