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细胞死亡+分型+WGCNA+泛癌,这种效果超赞!干湿结合扛起5分+大旗!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-06-04 17:29

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Multi-omics comprehensive analyses of programmed cell death patterns to regulate the immune characteristics of head and neck squamous cell carcinoma ”,这篇文章发表在 Transl Oncol 期刊上,影响因子为5。 结果: 评估HNSCC中细胞死亡类型的固有相关性景观 作者计划鉴定能够预示生存不良的基因,以建立基于细胞死亡的预后网络。因此,通过COX分析,作者鉴定出134个与细胞死亡相关的基因,其P值小于0.05且风险比大于1,适用于诱导肿瘤发生的细胞死亡模型(附表2-4)。作者从TCGA数据库获取了500个HNSCC样本,每个样本都有完整的临床特征数据。接下来,作者应用ssGSEA方法对HNSCC样本的转录组进行评估,以评估14种细胞死亡类型的得分。如图1A所示,Spearman相关性分析显示,这些细胞类型在癌组织中相互支持。根据相关性的强弱,这些细胞类型可以 ………………………………

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