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自己吓自己,还以为我博士生导师要让我做相分离!看完这南方医科大23.5分的Nature大子刊,他说让我给他讲讲思路……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2024-12-25 08:20
    

主要观点总结

本文研究了三阴性乳腺癌(TNBC)中组蛋白脱乙酰酶“H基因”的液液相分离(LLPS)现象。文章通过提出假设并验证,探讨了“H基因”的LLPS现象与磷酸化之间的关系,以及这一关系对肿瘤细胞增殖和迁移侵袭能力的影响。同时,文章还分析了“H基因”的LLPS对染色质组蛋白乙酰化、染色质互作和转录重编程的影响。

关键观点总结

关键观点1: 文章研究的重点是TNBC中的LLPS现象,尤其是“H基因”在其中的作用。

文章介绍了“H基因”的LLPS现象在TNBC中的特殊性,以及其与正常组和普通乳腺癌的差异。

关键观点2: 文章提出了关于“H基因”磷酸化对其LLPS贡献的假设,并进行验证。

通过抑制“H基因”的磷酸化,文章观察了“H基因”的LLPS现象的变化,证实了磷酸化对LLPS的影响。

关键观点3: 文章分析了“H基因”的内在无序结构域(IDR)在LLPS中的作用。

文章发现“H基因”蛋白序列上的两个IDR序列,其中IDR1对LLPS起到重要作用。同时,还发现了IDR1中的一个磷酸化位点对于LLPS的重要性。

关键观点4: 文章探讨了“H基因”的LLPS对肿瘤细胞和转录层面的影响。

文章分析了“H基因”的LLPS被抑制后,染色质结构、染色质可及性和转录活性的变化,并发现与原癌基因ATF3的表达有关联。

关键观点5: 文章的验证部分存在缺憾。

在验证ATF3与“H基因”的LLPS关联性时,文章稍显草率,可能需要更深入的验证。


文章预览

一篇文章要怎么看才能理清思路呢?其实就要看这篇文章的假设是如何提出,得到了什么样的结果,又通过假设的迭代如何推进整个课题的进展( 一篇文章或者一个课题,假设以及假设的迭代都非常重要,在假设的迭代过程中,会不知不觉地推动课题得到最后的结论,这都是对于文献阅读过程中比较重要的信息,不清楚假设以及假设迭代的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》 )。今天讲的这篇文章就挺有意思,这篇文章是南方医科大学广东省人民医院和中山大学两位博士研究生,发表在23.5分的Nature大子刊Nat Cancer上的文章,他们做的是相分离: LLPS(液液相分离)大家应该都熟悉了,这个在之前都介绍过。由于蛋白质的IDR(内在无序结构域),会导致蛋白质的聚集,与外界形成LLPS的状态: 这篇文章研究的就是TNBC(三阴性乳 ………………………………

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