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「学转录组入门生信」第四周根据差异基因进行富集分析及解读

生信媛  · 公众号  · 生物  · 2019-07-29 09:04
    

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前期回顾: 一个月能通过转录组入门生信吗? 「生信基础课」如何利用好手头的电脑,节省上千的服务器租用费 「学转录组入门生信」第一周从环境配置开始 「学转录组入门生信」第二周来获取表达量矩阵 「学转录组入门生信」第三周入门R语言和学习DESeq2 本周的学习简单来说可以分为两个阶段: 第一阶段:一代富集分析——GO和KEGG 使用biomaRt包注释差异基因 使用ClusterProfile包对差异基因进行富集分析 GO分析及结果解读 KEGG分析及结果解读 使用ggplot2包对分析结果作图 第二阶段:二代富集分析——GSEA 输入文件的格式解读与构建 GSEA参数的选择与基因集的构建 常见报错原因解读 结果解读 生物学意义解析 第三周的视频以及这一周的视频都会在bilibili上更新,地址为 htt ………………………………

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