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ICML2024|知识感知的强化学习优化的蛋白质定向进化方法

DrugAI  · 公众号  ·  · 2024-10-19 06:30
    

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论文题目: Knowledge-aware Reinforced Language Models for Protein Directed Evolution 本文作者: 王钰皓(浙江大学)、张强(浙江大学)、秦铭(浙江大学)、庄祥(浙江大学)、李晓彤(浙江大学)、宫志晨(浙江大学)、王泽元(浙江大学)、赵宇(腾讯)、姚建华(腾讯)、丁科炎(浙江大学)、陈华钧(浙江大学) 发表会议: ICML 2024 论文链接: https://openreview.net/forum?id=MikandLqtW 代码链接: https://github.com/HICAI-ZJU/KnowRLM 欢迎转载,转载请注明 出处 一、引言 定向进化是蛋白质优化的基石,是利用自然突变过程来增强蛋白质功能。现有的机器学习辅助定向进化(MLDE)方法通常依赖于数据驱动的策略,经常忽略生化领域的深刻领域知识。在本文中,我们为 MLDE 引入了一种新的知识感知强化语言模型 (KnowRLM)。构建氨基酸知识图(AAKG)来表示氨基酸之间复杂的生化关 ………………………………

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