单细胞转录组与单细胞ATAC测序数据关联分析思路

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单细胞转录组测序（scRNA-seq）是在单细胞水平上研究基因表达差异的技术，为细胞异质性研究提供了有力手段。而单细胞ATAC测序（scATAC-seq）是利用转座酶在单细胞水平上研究染色质开放性的技术，可以提供高分辨率的单细胞染色质开放图谱，有助于深入研究细胞异质性的表观遗传调控机理。它们的研究对象一个是mRNA，一个是染色质，而染色质开放性在很大程度上决定了基因的表达。因此，通过将scRNA-seq和scATAC-seq相结合，可以同时获得单个细胞的基因表达和染色质可及性的数据，这有助于我们深入了解从DNA到RNA再到表型的调控网络，帮助我们寻找核心基因和调控因子。今天，我们将探讨两组学数据关联分析的思路并结合案例来讲解思路应用的方法。 关联分析思路 两组学关联分析的核心在于通过相同细胞亚群的上调基因和上调peak分析来鉴定核心TF ………………………………