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生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-06-06 16:33

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Identification and validation of stemness-based and ferroptosis-related molecular clusters in pancreatic ductal adenocarcinoma”,这篇文章发表在 Transl Oncol. 期刊上,影响因子为5。 结果: 鉴定出两种具有不同生存结果的干细胞亚型 预测模型的整体建立在流程图中显示(图1a)。基于ssGSEA算法,计算了每个PDAC样本中26个干细胞基因集的富集分数。根据这些分数,进行了无监督聚类,将PDAC患者分为两个簇(C1,C2,图1c)。我们绘制了热图,展示了两个簇中ssGSEA干细胞分数的分布情况(图1b)。Kaplan-Meier曲线显示,与簇1组相比,簇2患者的总生存期较短(对数秩和p = 0.008,图1e)。此外,PCA分析表明这两个簇之间存在显著差异(图1d)。 WGCNA 用于识别干细胞模块 为了确定TCGA队列中两个干细胞簇的典型基因,我们进一步实施了WGCNA。首先, ………………………………

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