Nature：诺奖得主利用 AlphaFold 揭示病毒如何突破免疫防线

主要观点总结

Jennifer A. Doudna教授在Nature期刊发表了一篇关于病毒蛋白质预测和功能的研究论文。该研究利用AlphaFold等AI工具预测了近7万个病毒蛋白质的3D形状，揭示了病毒与宿主之间的相互作用机制，并为蛋白质的具体作用提供了新见解。研究还发现了感染真核生物的病毒和感染细菌的病毒使用古老的免疫逃逸机制，这些发现有助于开发新的抗病毒疗法。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景及目的

随着具有大流行潜力的病毒的出现，确定它们将如何与人类细胞相互作用非常重要。研究旨在通过预测病毒蛋白质的结构和功能，揭示病毒与宿主的相互作用机制，为开发新的抗病毒疗法提供启示。

关键观点2: 研究方法

研究团队使用AlphaFold预测蛋白质的三维结构，并通过深度学习工具对近4,463种感染真核生物的病毒的67,715种蛋白质的结构进行比对和分析。

关键观点3: 研究发现

研究发现，一些新预测的病毒蛋白与哺乳动物细胞中用于转运DNA和RNA的非病毒蛋白相似，暗示这些病毒蛋白可能具有转运功能。同时，研究揭示了病毒与宿主之间的意外相似性，多达25%的未注释病毒蛋白可能参与免疫逃逸。

关键观点4: 研究意义

研究发现的免疫逃逸策略为设计广泛有效的抗病毒疗法提供了新的可能途径。例如，找到病毒免疫逃逸的常见、保守方式，可能会产生能同时有效对抗多种不同病毒的强效抗病毒药物。

文章预览

2024 年 8 月 26 日，CRISPR 基因编辑先驱，2020 年诺贝尔化学奖得主   Jennifer A. Doudna 教授在   Nature  期刊发表了题为  Birth of protein folds and functions in the virome 的研究论文。该研究利用 AlphaFold 等 AI 工具预测了近 7 万个病毒蛋白质的 3D 形状，然后将新预测的结构与功能已知的蛋白质结构进行了匹配，为蛋白质的具体作用提供了新见解。研究还揭示了 感染真核生物的病毒和感染细菌的病毒用于同一种进化上保守的古老的免疫逃逸机制，这些发现有助于开发新的抗病毒疗法。 图源： Nature Jennifer A. Doudna 教授：随着具有大流行潜力的病毒的出现，确定它们将如何与人类细胞相互作用非常重要。 这项新研究提供了一个工具来预测那些新出现的病毒可能带来的影响。 为了确定病毒蛋白质的功能，研究人员通常比较其独特的氨基酸序列与已知功能的蛋白质 ………………………………