文献分享 ｜Nature Communications｜单细胞Total RNA-seq分析揭示转录调控中心

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大家好！为大家介绍一篇2024年发表在 Nature Communications 的文章，题目为“ Single-cell total-RNA profiling unveils regulatory hubs of transcription factors ”。本文中，作者 开发了一种基于多重退火循环扩增引物的单细胞Total RNA测序方法，具有同时检测单细胞中前体RNA与剪接后RNA的能力 。本文的通讯作者是美国贝勒医学院的Chenghang Zong。Chenghang Zong的研究方向集中于单细胞分析方法，包括单细胞算法开发、单细胞技术在肿瘤发生与衰老中的应用研究等。 背景介绍 RNA Velocity（RNA速率分析）是一种能够重塑RNA转录、剪接与降解过程的动力学分析方法，通过比较未剪接的前体mRNA和剪接后成熟mRNA的相对含量，来分析mRNA的剪接和降解速率。根据剪接前后mRNA丰度的动态变化，可以预测单细胞转录状态的变化趋势和细胞命运。目前常用的转录组分析方法是基于Oligo-dT引物捕获Poly ………………………………