主要观点总结
文章介绍了在单细胞数据分析中，如何使用小提琴图可视化marker基因并计算显著性。主要包括以下几点：展示基因在不同细胞群体的表达差异，通过小提琴图直观展示基因表达水平和分布情况，通过显著性计算确定基因在特定细胞亚群中的特异性表达，以及为后续功能研究提供线索。以pbmc数据和NKG7基因为例，详细说明了如何生成小提琴图，如何计算不同分组间的显著性，并展示了使用ggpubr包进行显著性标记的可视化。
关键观点总结
关键观点1: 小提琴图在单细胞数据分析中的应用
小提琴图可以直观展示基因在各个细胞亚群中的表达水平和分布情况，是单细胞数据分析的重要工具。
关键观点2: 如何生成目标基因的小提琴图
以pbmc数据和NKG7基因为例，介绍了如何载入数据、修改分群标识、计算marker基因，并使用VlnPlot生成目标基因的小提琴图。
关键观点3: 如何计算不同分组间的显著性
介绍了使用ggpubr包中的stat_compare_means函数进行不同组之间的显著性检验，包括选择需要比较的分组、设置检验方法、显示显著性标记等。
关键观点4: 显著性计算和可视化的重要性
通过显著性计算和可视化，可以帮助研究者发现基因在不同细胞亚群中的差异性表达，为后续功能研究提供线索。
关键观点5: 推广信息
介绍了共享服务器和生物信息学马拉松授课的相关信息，鼓励读者拥有自己的计算机资源并学习生物信息学基础知识。
文章预览
前情回顾 在这个月的前几期推文中，主要基于单细胞数据使用小提琴图可视化marker基因进行了整理： VlnPlot结果及常用参数浅析 基于VlnPlot参数及ggplot2美化小提琴图 也有一期答读者问—— 小提琴图有点无图是何缘由？ 这期就一起来学习一下 画目的基因的小提琴图并计算显著性！ 小提琴图可视化并计算显著性用途 在单细胞数据分析中， 通过小提琴图可视化和显著性计算可以帮助研究者直观且统计地评估目的基因在不同细胞群体中的表达差异 展示基因在不同细胞群体的表达分布 ：小提琴图可以直观地展示 基因在各个细胞亚群中的表达水平和分布情况 。 小提琴图能够反映 不同群体中表达的中位数、四分位数及表达值的变化范围 。特别是在复杂的细胞亚群中，这种分布展示非常有助于发现基因的差异性表达。 确定基因在不同亚群中的特异性表达
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