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转录组这 8 个高级分析,你做了吗?

生信益站  · 公众号  ·  · 2024-12-22 11:00
    

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生信益站,一点就有益 ! 祝友友们天天开心,月月发 CNS~ 设我为🌟星标,每天就能第一时间看到推送啦~ 年底了,给大家带来 全新的 bulk 转录组课程—— 课程大纲如下 0. 文章思路 1. linux 命令入门 2. R 语言入门 3. 数据质控 4. 比对+定量(矩阵一) 5. 差异分析 6. 富集分析 7. 高级分析 7.1 WGCNA 有时间序列,有表型性状,那就离不开它~ 7.2 TO-GCN 适用于多维数据(时间,条件,基因),时间序列比较转录组分析~ 7.3 GSEA 常规的ORA富集满足不了需求,那就试试GSEA呗~ 7.4 可变剪接 废物利用,结构分析之一~ ( 矩阵二,PSI) 7.5 APA/可变多聚腺苷酸 废物利用,结构分析之二 (矩阵三,PDUI)~ 7.6 RNA 编辑(含下游挖掘) 废物利用,结构分析之三 (矩阵四,RNA编辑计数)~ 7.7 拟时序分析 bulk也越来越时髦了~ 7.8 免疫浸润 医学必备( 矩阵五,免疫打分)~ 8. R语言绘图 ………………………………

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