SV、CNV和Indel基因型数据如何做GWAS分析？

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大家好，我是邓飞，今天介绍一下如何使用Indel和SV数据，进行GWAS分析，参考章节： 领取 | GWAS和统计遗传书籍汇总 中 GWAS书籍：《Genome-Wide Association Studies》，电子版pdf 的第十章： 变异概念介绍： indel（插入缺失变异） ： Indel是“insertions and deletions”的简称，指的是DNA序列中小的插入或缺失变异。具体来说，indel是一种常见的基因组变异，涉及到一个或多个碱基对的加入（插入）或删除（缺失）。Indel变异可能影响基因功能和表型。 SV（结构变异） ： SV是“structural variants”的简称，指的是基因组中的较大规模变异，通常涉及数百个碱基对到数百万个碱基对。常见的结构变异包括大规模的缺失、重复、倒位和易位等。SV可以对基因功能产生重大影响，并且常常与复杂的疾病和性状相关。 CNV（拷贝数变异） ： CNV是“copy number variations”的简称，特指 ………………………………