手头有组学和生信分析数据，如何用好才能实现文章突破？

文章预览

不管是自测还是公共数据库，测序等组学数据是大家手头上最容易拿到的数据。 先前大家通过生信分析可以批量水文章，现在组学数据和生信分析的意义正在发生改变，更重要的价值是如何从组学数据中发掘出“亮点”。 但是，组学数据的特点是又多又杂， 组学数据的解读和梳理、判断就是第一步，而后续的工作才是如何基于组学数据讲好故事。 今天我就来抛砖引玉分享一下， 当拿到组学数据的时候，如何从千头万绪的结果中挑选到线头并把故事讲好，步骤大致分为四步 ： 1 质控判断：从数据质量、样本、分组等整体情况看结果是否可信和可靠。 比如常见的 2 组 3 样本（ 3vs3 ）细胞的 RNA 测序结果，如果没有特殊情况下， 组内差异（ 比如三个 Con 对照、三个药物组之 间）一般小于组间差异的（药物组 vs Con ），这一点可以从样本 PCA 聚类等结 ………………………………