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唯一获批的WES Panel解析

玩转ATGC  · 公众号  ·  · 2024-07-01 07:30

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在介绍主角之前首先解答前面的一个疑惑。 前面介绍FoundationOne Tracker的时候( 参考 基于大Panel的Tumor-informed MRD产品--FoundationOne Tracker研究 )说到: 同样都是全外,都宣称覆盖了2万左右基因的全部外显子,为什么不同的WES Panel版本之间大小差别如此之大呢? 查询了各家公司的WES产品资料,安捷伦给出的相当清晰( 参考 安捷伦SureSelect WES Panel ),解答了我的疑惑: 根据上图所示,有一个常规的WES版本,然后 根据具体需求可在常规版本的基础上进行不同的定制 : 常规的版本35.1M,基于RefSeq,CCDS,GENCODE三个数据库中 编码蛋白区域(CDS区) 进行设计,另外还包括了TERT启动子区域。    定制一: 增加ClinVar,HGMD两个数据库中所有的致病和可能致病变异位点,以及ACMG 73个基因中的所有致病和可能致病变异位点。此步在常规版本基础上主要增加是 非编 ………………………………

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