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教程 | 如何参与诺奖级的研究

王初课题组  · 公众号  ·  · 2024-10-30 20:00
    

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——副标题:如何蹭一波热度 2024年诺贝尔化学奖授予蛋白质折叠与蛋白质设计的计算工作,如果你有兴趣利用自己有限的计算机资源体验一下诺奖级别的工作,请看下去。 Rosetta是David Baker实验室以及Rosetta社区多年来积累开发的专门进行蛋白建模的工具,可以折蛋白、写序列、做对接、做模拟、小分子、DNA、卤猪、卤鸭、酱鸡、腊肉……功能很强大,但是学习成本比较高,新东方不教。好在社区有人把它包装成了python包,还提供非常易用的教学文档(https://www.youtube.com/playlist?list=PLFavr8uo6kSqDB1cbXUDFZSooNk537teC)。 假如你有自己想算的东西,但没有足够的计算资源,也可以尝试Robetta服务,这是基于分布式科学计算平台Boinc的专做蛋白折叠任务的工具,现在也支持更新的RoseTTAFold。在上面提交蛋白序列和模板(如果有的话),就可以很快得到蛋白结构预测。 ………………………………

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