Nat. Methods | 基于DNA测序研究单细胞空间蛋白质组

文章预览

大家好，本周为大家分享一篇发表在 Nat u re Met hods 上的文章，题目为 Molec ular pixelation: spatial proteomics of single cells by sequencing 。本文通讯作者均来自 Pixelgen Technologies ，分别为该公司的 CEO ， Simon Fredriksson 以及 CTO ， Filip Karlsson 。 Pixelgen Technologies 致力于发展空间蛋白质组学技术，且已经将本文所介绍的方法实现了商业化。 细胞表面蛋白质的空间分布制约着免疫系统的重要过程，如细胞间的交流和移动。然而，荧光显微镜在亚细胞水平上高通量多标成像具有较大局限。本文中，研究人员发展了分子像素化（Molecular Pixelation，MPX）技术，利用抗体-寡核苷酸偶联物（antibody–oligonucleotide conjugates，AOC），以高度多重的方式检测细胞表面蛋白质的排列。该技术无需光学设备，无需固定样品或单细胞分隔，可在标准反应管中进行。 MPX技术中，主要用到AOC与DN ………………………………