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学完了生信技能树的马拉松授课,算是掌握了跟人工智能对话的基础,比如前些日子看到的练习题: PDX小鼠模型的单细胞样品定量能选择人类参考基因组吗 ,是需要下载这个CRA010501数据集里面的单细胞转录组样品的fq文件,然后走cellranger定量流程,选择人类以及小鼠参考基因组,各自走一遍定量流程,然后两个表达量矩阵分开做一下降维聚类分群哈, 看看背后是否有一些被忽略的生物学现象。 需要使用的数据库文件批量下载脚本是 : for i in {34..39}; do ( axel -n 20 https://download.cncb.ac.cn/gsa2/CRA010501/CRR7274 ${i} /CRR7274 ${i} _f1.fq.gz ); done for i in {34..39}; do ( axel -n 20 https://download.cncb.ac.cn/gsa2/CRA010501/CRR7274 ${i} /CRR7274 ${i} _r2.fq.gz ); done 如果网络好基本上也就是等一个晚上就下载完毕, 但是大部分情况下,这个下载会中断! 我首先让人工智
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