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测序中国
AJHG | 哈医大邵婷婷/徐娟团队构建人类癌症单细胞变异图谱数据库:CanCellVar
测序中国
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公众号
· · 2024-07-11 15:25
文章预览
变异,包括DNA中的单核苷酸变异(SNV)和mRNA中的A>G RNA编辑,作为细胞增殖和肿瘤发生的重要驱动因素,通常与癌症进展和生长有关。在不同癌症之间,甚至在同一癌症的不同肿瘤之间分布模式、变异频率和光谱都有显著差异。目前,数千种癌症已经进行DNA和RNA测序,并建立了数据库。但大多数关于变异的研究和数据库分析的是全肿瘤(bulk tumor),它是癌细胞、免疫细胞和基质细胞的混合物,反映了不同亚克隆的平均特征。然而,在单细胞分辨率下,癌细胞的异质性以及浸润和驻留宿主细胞的变异异质性在很大程度上仍然未知。因此,挖掘和总结单细胞变异将提供更精细、更高分辨率的癌症视图,并进一步促进精准医疗。同时,我们需要一个用户友好的数据库,包括丰富的单细胞变异数据和有效的工具来研究人类癌症的遗传异质性。 为此,哈尔滨 ………………………………
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