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分享5个实用的基因结构分析绘图工具

SCIPainter  · 公众号  ·  · 2024-07-29 11:10
    

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1 gggenes绘制基因结构图 #CRAN稳定版安装; install .packages( "gggenes" ) #包的载入; library (ggplot2) library (gggenes) #自定义配色; mycol             '#6A8EC9', '#652884' ,'#652884' ,'#8A7355', '#CC5B45','#B46DA9') #绘制基因结构图; ggplot (example_genes[1:42,], aes(xmin = start, xmax = end, y = molecule, fill = gene)) +    geom_gene_arrow (arrowhead_height = unit(6, "mm" ),                    arrow_body_height  = unit(4, "mm" )) +    facet_wrap (~ molecule, scales = "free" , ncol = 1) +    scale_fill_manual (values = mycol)+    labs (y= "" ) +    theme_genes () #在箭头中添加基因标签; ggplot (example_genes[1:42,], aes(xmin = start, xmax = end, y =                              molecule , fill = gene, label = gene)) +    geom_gene_arrow (arrowhead_height = unit(6, "mm" ),                    arrow_body_height  = unit(4, "mm" ),            ………………………………

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