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CRISPR介绍—向导RNA(gRNA)的设计和选择

IVD分享库  · 公众号  ·  · 2024-07-17 09:00
    

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来源:迅识生物 CRISPR/Cas系统作为新型的分子研究工具,正在被越来越多的应用于疾病治疗(基因编辑等)、分子诊断、遗传育种等各个领域,也是近几年的研究热点。无论是在基因编辑还是在分子检测应用中,CRISPR/Cas系统的工作效率高度依赖于CRISPR RNA(crRNA)的设计,其作为gRNA的重要组成部分,可与靶点序列配对,是系统灵敏度和特异性的保障。高效的crRNA设计,主要基于生物信息学和计算工具的不断进步和迭代优化。目前,适用于crRNA设计的网页工具在30种以上,如何选择crRNA的设计工具、高效的开展研究工作是首要的任务,其中最常用的是几种线上工具,包括 E-CRISP、CRISPick、CHOPCHOP、CCTop、CRISPR RGEN和CRISPOR ,本文将针对上述设计工具进行系统性介绍。 一、  crRNA设计网页工具 在选择设计工具前,首先根据研究目的选择适合的工具,即体外检测 ………………………………

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