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生信精准科研
这才是当下最正的多组学联合分析(๑•̀ㅂ•́)
生信精准科研
·
公众号
· · 2024-07-01 07:10
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多组学方法揭秘结直肠癌中肠道微生物群和肿瘤免疫状态的决定因素 Pharmacological Research (IF9.3; Q1) 概况: 本研究中, 分析了包括微生物组、代谢组、转录组和CRC患者单细胞RNA测序在内的多组学大规模数据集 ,通过生物信息学方法进行单独和综合分析。进一步再用人类微生物群重新定植的小鼠中检查了这些发现的临床相关性。发现,与健康对照组相比,CRC患者具有独特的微生物群组成。 研究开发了一种使用28种生物标志物的机器学习模型,用于检测CRC,该模型具有高准确性和临床适用性。 确定了属和特征基因之间的多个显著相关性,表明肠道微生物群在肿瘤免疫中的潜在作用。进一步的分析表明,特定的代谢物在这些属和肿瘤免疫之间起着关键作用。 此外,从CRC患者移植的肠道微生物群影响了CRC对免疫治疗的反应。这些表型与肠道微生物群 ………………………………
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