专栏名称: 生信钱同学
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多个marker连用,判断亚群更准一些,也是一行代码运行完

生信钱同学  · 公众号  ·  · 2024-09-08 11:06
    

主要观点总结

文章主要介绍了生信分析中的可视化方法和工具,包括多marker联合展示、不同生信可视化方法的差别,以及R包安装和使用的建议。同时,文章还提到了空间组学的学习内容,并分享了相关的代码和推荐学习资源。

关键观点总结

关键观点1: 生信可视化方法和工具的介绍

文章提到了生信分析中的可视化方法,包括多marker联合展示,掌握了不同的生信可视化方法对于生物信息学的研究非常重要。

关键观点2: R包安装和使用的建议

文章给出了一些R包安装和使用的建议,包括使用BiocManager安装Bioconductor的镜像源以及解决R包安装困难的问题。

关键观点3: 空间组学的学习内容

文章强调了空间组学的学习内容,包括单细胞测序、空间转录组等领域,并分享了相关的学习资源。

关键观点4: 代码分享和推荐学习资源

文章分享了一些生信分析的代码和学习资源,包括单细胞、空转、生信基础手把手教学系列等,对于生物信息学的学习者很有帮助。


文章预览

不设置🌟有时会收不到公众号内容,code一段时间后会失效,代码在 文末 昨天给大家介绍了基本的使用,其实它还可以进行多marker联合展示,多个marker进行标注 掌握不同的生信可视化方法还挺重要的,差别很大,代码分享 (昨天的) if (!requireNamespace( "BiocManager" , quietly = TRUE )) install.packages( "BiocManager" ) options(BioC_mirror= "https://mirrors.westlake.edu.cn/bioconductor" ) getOption( "BioC_mirror" ) #确认下 BiocManager::install( "Nebulosa" ) install.packages( "ggrastr" ) library(Nebulosa) library(ggrastr) Nebulosa::plot_density(seu, c( 'CD3' , 'CD8' , "PD-1" ), joint =  TRUE ) 装不上的可以试试这个,我是一下子就装上了 R包安装困难?那就试试西湖大学的镜像;easyTCGA包一键出各种统计图 ,推荐大家去试试 近期推文: 代码挺全面的一篇文章,咱们的课题生信部分基因上都会设计到 上游分析必须要会linux ………………………………

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