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一早曾老师 小明 发来一个卖十块钱的推文。不点开不知道,这么不走心,就用着我包里的示例数据。这可是十几年前 clusterProfiler 刚上线就打包在里面的、从版本1到版本4的祖传示例。 你们的钱真好赚,话说十几年前,清一色还是microarray,大家都在case-control的时候,我就想到了要针对复杂一点的实验设计来做。这就是clusterProfiler的卖点,写在了标题里, 比较生物学主题 。 现在用在单细胞上,是真的爽,每个cluster都有自己的marker genes,一行代码,直出生物学通路,每个cluster有啥自己独特的通路,又有啥cross talk?一目了然。 这种图,虽然现在大家看得多了,但我刚写的时候,是十几年前了,独家,必须是独家。然后现在虽然看得多,但不是用clusterProfiler画的,还是少了很多细节考量的,你点开下面图就知道了。 最后的最后,你的marker genes,我
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