Sci Adv丨倪挺/李磊合作开发新算法揭示基因可变串联转录起始介导的促癌机制

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基因组变异和表观遗传层面的改变大大增加了癌细胞转录组的复杂性。基因的可变转录起始主要分为两种： 可变第一个外显子和可变串联转录起始 。可变第一个外显子指从相距较远的不同启动子转录起始产生不同第一个外显子的转录本，而可变串联转录起始指从复合型转录起始区域的不同串联转录起始位点转录起始产生5′非翻译区 （5′ UTR） 长短不同的转录本 （图1A） 。已有多项研究报道可变第一个外显子介导的基因表达调控参与癌症发生发展 【1-3】 。然而，在癌症发生发展过程中可变串联转录起始位点使用的动态变化及其介导的基因表达调控的生物学作用尚不清楚。 2024年7月10日，复旦大学生命科学学院 倪挺 团队联合深圳湾实验室 李磊 团队在 Science Advances 在线发表了题为 Pan-cancer transcriptome analysis reveals widespread regulation through alternative tande ………………………………