主要观点总结
文章介绍了美国纽约大学Neville E. Sanjana团队在Cell杂志发表的研究，利用CRISPR-Cas13技术对细胞中的lncRNAs进行了高通量筛选，避免DNA层面基因编辑带来的脱靶效应，鉴定了大量关键lncRNAs。这些lncRNAs与细胞增殖、凋亡、分化等生理过程密切相关。
关键观点总结
关键观点1: 研究背景
人体基因组转录大量的长非编码RNA（lncRNAs），其中不到1%具有明确的功能。这些lncRNAs具有低序列保守性、低表达丰度以及细胞特异性表达谱等特点，鉴定其功能是一大挑战。
关键观点2: 研究方法
研究人员使用CRISPR-Cas13技术在5种细胞系中对lncRNAs进行了高通量筛选，避免DNA层面基因编辑带来的脱靶效应。通过设计一个包含75000个gRNAs的文库，研究人员靶向了6199个lncRNAs和其邻近的4390个PCGs，并在实验第0、7和14天进行细胞收集和分析。
关键观点3: 研究成果
研究鉴定了大约778个关键lncRNAs，其中大部分具有细胞特异性。结果显示大约10%的lncRNAs是细胞生存的关键基因。此外，研究人员还发现了与细胞增殖密切相关的lncRNAs，并探究了它们的功能和表达谱。
关键观点4: 研究意义
本研究建立了一种新的方法，能够更准确的分析细胞中关键基因的功能，为后续高通量基因筛选提供了新的研究思路。此外，该研究对于理解lncRNAs在细胞生理过程中的作用以及开发新的治疗方法具有重要意义。
文章预览
撰文 | 存中一贯 人体基因组转录大量的长非编码RNA （long noncoding RNAs, lncRNAs ） ，这些lncRNAs中只有不到1%的具有明确的功能 【1】 ，包括封闭microRNAs，抑制翻译，形成大分子复合物，编码短肽以及调节蛋白或者RNA功能等 【2-4】 。这些lncRNAs的低序列保守性、低表达丰度以及细胞特异性表达谱等特点使其很难与不稳定的转录背景区分开来 【5,6】 。近期， CRISPRi和CRISPRa技术被用来鉴定lncRNAs的功能，虽然取得了许多成果，但Cas9依赖的方法往往会对靶点序列附近基因产生影响，进而影响对lncRNAs功能的鉴定，这是DNA依赖技术难以避免的技术缺陷。 近日，来自美国纽约大学的Neville E. Sanjana带领团队在 Cell 杂志发表了他们最新的研究成果，题目是 Transcriptome-scale RNA-targeting CRISPR screens reveal essential lncRNAs in human cells ， 他们利用CRISPR-Cas13技术在5种细胞系中对lncRN
………………………………
