Monocle 3官网教程-6-投射参考数据集与保存结果

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本次分享内容 本次分享教程：https://cole-trapnell-lab.github.io/monocle3/docs/projection/ 本次分享教程：https://cole-trapnell-lab.github.io/monocle3/docs/store_monocle_objects/ 将查询数据集投影到参考数据集上 共嵌入用于比较相似的数据集，以识别相似性和差异性并在单元格之间传输注释。当数据集很大并且有很多集合需要比较时，处理共嵌入数据的内存和运行时间要求可能会成为障碍。Monocle3 的解决方案是保存将参考数据集转换为低维 PCA 和 UMAP 空间的模型，然后使用这些模型将查询数据集转换为低维参考空间，在低维参考空间中可以绘制它们以进行比较或通过查找相似的参考单元格来注释查询单元格。 加载参考和查询数据集 我们首先将参考和查询数据集加载到 Monocle3 中。为了简化此示例，我们将两个数据集一起加载；但是，可以独立处理它们。 library(monocle3) library(Mat ………………………………