文章预览
作者:梅菜 编辑:李宝珠,十九 中国科学院天津工业生物技术研究所的新酶设计团队,开发了基于扩散模型和口袋设计原则的 P450 酶从头设计方法 P450Diffusion。 细胞色素 P450 酶几乎于所有生物体中普遍存在,在生命成长和发育的各种代谢过程中发挥着重要作用。作为自然界中最通用的生物催化剂,P450 酶不仅能催化超过 95% 已报道的氧化还原反应,而且能在温和条件下选择性氧化惰性碳-氢键, 被誉为工业应用中的「万能催化剂」。 如今,定向进化已广泛应用于设计具有更好性能的新型 P450 酶,然而,传统方法通常需要多轮随机诱变和高通量筛选,因此无论是 执行实际实验 还是通过计算机模拟计算,都很难详尽地探索潜在的蛋白质空间。 尽管深度学习在蛋白质结构预测方面取得了显著成就,但理想的功能设计仍然是一项巨大挑战——在进行蛋白
………………………………