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Simple Tree Viewer | 进化树快速可视化,TBtools 实用新功能~

生信石头  · 公众号  ·  · 2024-08-19 08:34

主要观点总结

文章介绍了作者对TBtools软件中进化树可视化功能的改进想法,并提到了新的功能“Simple Tree Viewer”。作者提到当前进化树可视化软件的不足,表示希望新功能能简单、易用,只要求用户放入树文件即可展示。此外,作者还提到了众筹活动,参与者有机会获得未来开发的插件,该插件将支持无根树的可视化并具备交互式界面。最后,文章提供了小程序参与众筹的方式。

关键观点总结

关键观点1: 实现进化树可视化功能的改进

作者计划实现一个新的功能“Simple Tree Viewer”,以改进TBtools软件中的进化树可视化功能,该功能抽取自已有的类并进行优化。

关键观点2: 新功能特点

新功能要求用户只需放入树文件即可进行可视化展示,具备简单、易用的特点。

关键观点3: 众筹活动及回报

作者发起了众筹活动,参与者可以支持新功能的开发,并有机会获得未来开发的插件。该插件将支持无根树的可视化,并具备交互式界面。

关键观点4: 新功能的未来展望

作者表示新功能开发完成后将直接开放到TBtools主程序,而众筹开发的插件在完成后至少一年内不会对外开放。


文章预览

Emmm,这两天摸鱼,实现了三四个进化树置根相关逻辑。 一直以来,TBtools 缺少一个相对独立的「进化树」可视化功能。事实上,我很久以前就写过一个 TreeTreeTree,当然,这个功能可以做相对复杂的进化树和数值矩阵联合可视化,但是并不太实用。另外,市面上进化树可视化的软件实在太多了,也有非常多优秀的软件和工具。 一般呢,都是直接用 TBtools Gene Structure View 来看进化树,但说实话,不太方便。 至于 Figtree 和 Dendroscope 也类似。他们都有一个问题,就是没那么方便,简单来说,我只想树放进去,你给我展示出来。至于其他功能,我其实不是非常 Care。为此,我今天想顺手实现一个功能。 名字叫做「Simple Tree Viewer」和「Simple MSA Viewer」类似,主要功能代码抽取自之前已有的类,然后再优化之类。 大体界面如下 最终效果,就是你放进去一个树 ………………………………

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