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cellchat细胞通讯1-数据输入与对象构建

生信漫漫学  · 公众号  ·  · 2024-12-15 09:16
    

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写在开头 在 不走弯路的学习法:结合官方教程和前辈推文双管齐下! 中提到要开始学习单细胞高级分析啦,然后因为决定不能只靠推文进行偷懒的学习,所以开始啃Cellchat的官网教程 首先 直接在浏览器搜索cellchat,就会出来Github及其网站的链接,以及Haley笔记中关于cellchat部分内容的整理 cellchat官网资料及参考推文 那咱们就以搜索结果为准进行学习,首先是 Github上的cellchat https://github.com/jinworks/CellChat?tab=readme-ov-file 在Github的README帮助文档里面,有提到安装cellchat的方法以及其依赖包 devtools::install_github( "jinworks/CellChat" ) 分析的教程在Tutorials的Analysis of single-cell transcriptomics data部分,先学单细胞转录组学叭! 单个数据集的 CellChat 分析完整教程,包括每个函数的详细说明——https://htmlpreview.github.io/?https://github.com/jinworks/CellChat/blob/master/tutorial/CellChat-vigne ………………………………

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