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最新m6A单细胞分析思路分享

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-07-28 07:00
    

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N6-甲基腺苷(m6A)近年来备受关注,然而大部分m6A研究都是基于组织数据进行的。目前已发现m6A具有显著的细胞特异性,这使得在单细胞水平对m6A进行分析变得至关重要。因此,今天小编想和大家分享一篇最近发表在 GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS(11.5/Q1) 杂志上的文章,该文章开发了单细胞水平定量m6A的方法,这对于更好地结合m6A与单细胞分析具有重要意义。 Scm6A: A Fast and Low-cost Method for Quantifying m6A Modifications at the Single-cell Level Scm6A:一种在单细胞水平上定量m6A修饰的快速低成本方法 添加微信 精彩推送不错过 一.文章摘要 该研究开发了一种基于机器学习的单细胞m6A定量方法:Scm6A,利用了来自m6A反式调控因子表达水平的输入特征(trans)和顺式序列特征(cis),具有显著的预测效率和可靠性。研究也通过m6A-seq及Scm6A对相同CD4+和CD8+ T细胞进行分析,观察到Scm6A ………………………………

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