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(终篇)当导师只给我一个RNA-Seq数据,我是怎么设计出5个课题的

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2024-08-12 11:30
    

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本期我们说最后1个课题思路: 从药物出发确定研究主题 这次我从过血脑屏障的药物出发来设计,这点我想就不用多解释了。 首先我找到过血脑屏障的600多个小分子化合物 (图1) : 图1 这些化合物的靶点归类到不同的功能和通路上 (图2) : 图2 下面,我尝试从基因和功能角度建立药物与脑卒中的联系,即假定存在 “药物-基因-功能-脑卒中” 的作用轴,因此从药物调控和基因的功能开展联合分析,并排除我们之前关注的主题(如炎症、细胞焦亡、吞噬作用和高尔基体-外泌体),尝试找到不同的新作用。 因此综合图2的功能和差异基因的功能,总体筛选出来两个感兴趣的主题: 代谢(metabolism) 和 细胞骨架(cytoskeleton) 。其中代谢与脑卒中的关系报导比较多 (图3) , 图3 像能量代谢 (图4) 、脂代谢 (图5 )等都有比较多的参考,当然也可 ………………………………

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