超级虚拟库筛选，肽与类肽低聚物的1E+60化学空间

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Molecular Informatics ,  2024 , Oct 10th DOI: 10.1002/minf.202400186 最近被人多次问起 “chemical space" 这个词，我一直在思考怎样把它更具象化，于是就特别留意这方面的报道。刚巧就看到了一篇paper讲述关于环状肽与类肽的，也是我比较关注的方向。 这篇文章介绍了一个 包含10 60 个成员的虚拟肽库 ，由100种商售肽和类肽砌块分子构成，每个构建成员最多由30个砌块单元组成 线性或环状肽 。作者使用一种 肽设计遗传算法（PDGA） 展示了 基于配体的虚拟筛选（LBVS） ，利用 “分子指纹” 相似性函数，以类似于给定靶分子进行进化、探索。下面详细了解一下。 主要内容 （1）构建虚拟肽库：元件、特征 （2）遨游虚拟 “化学空间”：“目标靶分子”、与“非肽靶分子"类似物偶遇 （3）总结与展望 01 构建虚拟肽库 分子砌块元件、方法、特征 自从90年代组合化学出 ………………………………