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Genome Biol | 杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2024-10-11 08:45
    

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人类转录组中存在大量的RNA突变信息,其主要是 人腺苷脱氨酶 ( ADAR ) 催化的腺苷 (A) 到肌苷 (I) 的RNA编辑 (A-to-I RNA editing, REs) ,如何能从海量转录组数据中排除测序错误、比对错误以及DNA突变等信息的干扰,有效且精准地识别这些RNA编辑位点是转录组计算生物学领域的研究难点。近期,以深度学习为代表的人工智能方法,在各个领域展现出强大的应用前景,为解决如何从RNA测序数据中精确区分RNA编辑与DNA突变的这一难题提供了新的思路。 2024年10月08日, Genome Biology 在线发表了复旦大学生物医学研究院 杨力 研究组题为 DEMINING: a deep learning model embedded framework to distinguish RNA editing from DNA mutations in RNA sequencing data  的最新研究成果, 本研究发布了一套新型计算分析框架——DEMINING,可以从RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点。 本研究开 ………………………………

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