天哪噜！单基因泛癌分析纯生信能发到近10分

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今天和大家分享发表在 EBioMedicine（IF:9.7） 杂志上的使用公共数据资源进行纯生信分析的关于研究泛癌中HER2指数从而揭示了HER2靶向治疗转录模式的文章。 一．研究背景 HER2的扩增和过表达在精准医疗中具有重要意义，同时在乳腺癌或胃癌患者中，HER2是一个可识别的抗HER2治疗靶点。此外，泛癌中存在广泛的HER2改变，这表明HER2靶向治疗可能拥有更广的应用范围。然而，目前这类治疗的生物标志物仍然不足，并且仅限于乳腺癌和胃癌。因此， 这篇文章利用TCGA数据库去阐明泛癌中多组学HER2状态的图谱。文章还开发了一种机器学习方法来评估不同癌症亚型中的HER2富集表达模式， 这可能为抗HER2疗法在更广泛的癌症中应用提供了线索。 二．研究数据及方法 1.数据： 作者下载了 TCGA中泛癌的拷贝数数据、突变数据、表达数据及临床数据 。此外，作者还下载 ………………………………