单细胞免疫组库VDJ|从数据下载开始完成cellranger vdj分析（1）

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单细胞免疫组库可以额外做啥？ scTCR可以更细致的获取肿瘤免疫微环境的变化，比如单细胞转录组可以获取不同样本，不同分组（癌和癌旁，是否治疗，是否响应）的celltype组成，可以知道哪些celltype发生变化。 而TCR可以进一步的得知发生变化的celltype中clone扩展情况如何，治疗响应组中clone是变多了还是变少了？不同celltype之间是否共享一些clone？是否出现了noval的clone？clone最多的TCR序列是哪些？这些序列和哪些peptide结合最强？是否可以用于CAR-T或者TAR-T治疗等等。 本系列会使用2021年Cancer Cell文章“ Single-cell sequencing links multiregional immune landscapes and tissue-resident T cells in ccRCC to tumor topology and therapy efficacy ”中的部分样本作为示例展示TCR的常见应用场景以及可视化。 该数据集的 多个 样本都有多处采样位置，多数样本同时含有RNA和TCR数据，且含有治疗前 ………………………………