J. Med. Chem. | 通过深度学习设计靶向AR的PROTAC肽

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大家好，今天分享一篇发表在Journal of Medicinal Chemistry上的文章“ A Top-Down Design Approach for Generating a Peptide PROTAC Drug Targeting Androgen Receptor for Androgenetic Alopecia Therapy ”，通讯作者为来自西安交通大学第一附属医院的李磊教授和第二军医大学的李翔教授，其中前者的主要研究方向为泌尿系统肿瘤的诊疗，后者的主要研究方向为多肽药物化学。 近年来，以RFdiffusion、ProteinMPNN和Chroma等为代表的深度学习算法在工程蛋白设计方面——尤其是对于多肽结合剂（binder）的设计——取得了令人瞩目的成就。 本文中，作者以雄激素受体（AR）作为感兴趣靶点，通过深度学习算法从头生成了两段分别对靶蛋白和E3连接酶VHL具有强结合能力的多肽，并据此“自上而下”地设计了一条靶向AR的PROTAC肽，最终成功将其用于雄激素性脱发的治疗。 作者使用经典的RFdiffusion/ProteinMPN ………………………………