如果你测了单细胞，那么这篇文章思路绝对适合你

文章预览

今天的文章配色满满都是原谅色，真贴心，作者肯定是心疼大家看文献眼睛累 ！文章发表于 Clinical Cancer Research（IF:10） 杂志: 作者基于单细胞转录测序的方式揭示了胃癌免疫微环境的特定细胞状态和构建了细胞间通讯网络。 单细胞基因组特征揭示胃癌肿瘤微环境中细胞重编程 一.研究目的 肿瘤微环境(TME)可以影响细胞状态和功能，不同TME对免疫治疗产生截然不同的影响。基于单细胞分辨率有利于识别肿瘤内异质性和肿瘤间异质性，更好表征TME中不同细胞特点。因此， 作者使用单细胞转录组测序手段对胃癌，胃肠上皮化生，配对正常组织和外周血样本进行分析，为筛选胃癌的潜在免疫治疗标志物和靶标奠定理论基础。 二.方法解读 1.组织处理和单细胞测序 1.1 样本来源： 胃癌(7)+胃肠上皮化生(1)；配对正常组织(8)+PMBCs(2) 1.2 制作高质量单细胞悬液： ………………………………