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Nat. Commun. | 用于快速稳定的机器学习力场的欧几里得Transformer

DrugAI  · 公众号  ·  · 2024-10-05 00:01

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DRUG AI 今天为大家介绍的是来自Stefan Chmiela团队的一篇论文。近年来,基于从头参考计算(ab-initio reference calculations)的机器学习力场(MLFFs)取得了巨大的进展。尽管这些力场在测试中表现出较低的误差,但由于在分子动力学(MD)模拟中长期不稳定性的问题,其可靠性正受到越来越多的关注。作者的研究发现,累积误差的稳健性与MLFF中等变表示的使用之间存在潜在联系,但这种表示的计算成本较高。为了解决这一问题,作者提出了一种名为的transformer架构,它结合了稀疏等变表示(欧几里得变量)和一种将不变信息与等变信息分离的自注意机制,避免了复杂的张量积运算。实现了准确性、稳定性和速度的权衡,使得对物质量子特性的深入分析成为可能,适用于更长的时间尺度和更大的系统规模。为展示其能力,作者生成了包含数百个原子的柔性肽 ………………………………

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