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全基因组DNA甲基化测序数据工作流程分析和性能评估,分析软件比较

甲基化  · 公众号  ·  · 2024-12-12 08:00
    

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DNA甲基化与转录调控、基因组印记、干细胞分化、胚胎发育和炎症等过程有关。DNA甲基化异常可能揭示疾病状态,包括癌症和神经系统疾病。因此,人类基因组中5-甲基胞嘧啶(5mC)分布和位点是一个重要的研究方向。全基因组重亚硫酸盐测序(Whole-genome bisulfite sequencing, WGBS)是一种用于分析DNA甲基化的高通量方法, 本文综述了WGBS的关键步骤,总结了可用且最新的分析工具,比较了比对算法,并分享了数据处理的示例代码,为科研人员的DNA甲基化研究提供参考。 标题: Analysis and Performance Assessment of the Whole Genome Bisulfite Sequencing Data Workflow: Currently Available Tools and a Practical Guide to Advance DNA Methylation Studies 期刊: 《small methods》 时间: 2022年3月 影响因子: 10.7 WGBS文库制备 广泛使用的亚硫酸盐转化文库构建方法:Accel-NGS Methyl-Seq(Accel)、TruSeq DNA Methylation ………………………………

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