TAU | 轻松拿到「组织特异性表达」基因

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写在前面 组织或器官，特异或偏好表达基因鉴定，是一个非常非常久远就受到大多数人关注的事情。鉴定组织特异性或者偏好表达基因，可以获取其启动子，用于在特定时间特定位置表达特定基因。 针对这类基因的挖掘和计算方法有很多，但最为常用的即为 TAU Index。简单来说，TAU Index 计算，对于每一个基因，基于他在不同组织的表达量，计算出一个 0~1 的数字。如果是 1 ，那么这个基因就是在某个组织里面特异性表达。如果是接近 1 ，比如 0.9，那么就是组织偏好性表达。如果是接近 0 ，那么就是倾向于组成型表达。当然，我们可以想象得到，逻辑上大部分基因应该是偏向于组成型表达。具体大伙可以自己统计看看。 回到主题，尽管TAU计算逻辑简单，几年前我即想写一个简单工具，方便大伙使用，但一直也没时间。 正好近期合作项目课题组提及 ………………………………