专栏名称: 生信菜鸟团
生信菜鸟团荣誉归来,让所有想分析生物信息学数据的小伙伴找到归属,你值得拥有!
今天看啥  ›  专栏  ›  生信菜鸟团

UMI-tools —— UMI标识处理工具

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2024-10-08 22:02

文章预览

工欲善其事必先利其器 UMI-tools 唯一分子标识符(Unique Molecular Identifiers ,简称UMIs) 是一种用于识别和区分单个分子的技术,有助于在测序过程中区分真实的生物分子和由 PCR 扩增引起的重复分子。umitools 是一个用于分析含有唯一分子标识符(UMIs)的高通量测序数据的生物信息学工具,它通过提取、校正、去重和计数等功能,帮助研究者准确分析单细胞 RNA 测序数据,从而揭示细胞异质性和基因表达模式。 GitHub:https://github.com/CGATOxford/UMI-tools 官方文档:https://umi-tools.readthedocs.io/en/latest/ 编程语言:Python 发表文章 题目 : UMI-tools: Modelling sequencing errors in Unique Molecular Identifiers to improve quantification accuracy 期刊 :Genome Research 日期 :2017年1月 作者 & 单位 :Tom Sean Smith & & 剑桥大学 DOI :http://genome.cshlp.org/lookup/doi/10.1101/gr.209601.116 如何安装 由于依赖项过多 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览