专栏名称: 生信修炼手册
记录自己在生信工作中的点滴积累,将自己的想法和观点和大家分享。内容来源于实践,干货满满!
目录
今天看啥  ›  专栏  ›  生信修炼手册

GEPIA:TCGA和GTEx表达谱数据分析平台

生信修炼手册  · 公众号  ·  · 2019-06-21 19:32

文章预览

欢迎关注”生信修炼手册”! GEPIA整合了来自TCGA和GTEx项目中的基因表达谱数据,提供了多种数据分析和可视化功能,操作简单,方便广大科研人员对肿瘤的表达谱数据进行挖掘,对应的文章发表在Nucleic Acids Research,链接如下 https://academic.oup.com/nar/article/45/W1/W98/3605636 该web平台的网址如下 http://gepia.cancer-pku.cn/index.html 通过首页的检索框,可以快速检索单个基因的相关结果 以 TP53 为例,结果如下 1. General 这部分对基因的功能进行了简单描述,同时给出相关数据库的链接,示意如下 右侧的body map中红色代表肿瘤患者, 绿色代表正常个体,给出了在不同组织中的表达量,颜色越深,对应的表达量越高,鼠标点击可以看到具体的表达量。 还给出了不同肿瘤中正常样本和肿瘤样 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览